JCLEC bernaung di bawah Lemdiklat Polri
JCLEC secara resmi bernaung di bawah Lembaga Pendidikan dan Pelatihan Polri (dengan nama Pendidikan dan Pelatihan Khusus Kejahatan Transnasional). Kepala Lembaga Pendidikan dan Pelatihan Polri menjadi Dewan Pembina JCLEC.